Understanding thoracic surgeons' perceptions of administrative database analyses and guidelines in clinical decision-making

ObjectivesThis study explored cardiothoracic surgeons' perceptions of health services research and practice guidelines, particularly how both influence providers' clinical decision-making.MethodsA trained interviewer conducted open-ended, semistructured phone interviews with cardiothoracic surgeons across the United States. The interviews explored surgeons' experiences with lung cancer treatment and their perceptions of health services research and guidelines. Researchers coded the transcribed interviews using conventional content analysis. Interviews continued until thematic saturation was reached.ResultsThe 27 surgeons interviewed mostly were general thoracic surgeons (23/27) who attend tumor board weekly (21/27). Five themes relating to physician perceptions of health services research and guidelines emerged. Databases analyses' inherent selection bias and perceived deficit of pertinent clinical variables made providers skeptical of using these studies as primary decision drivers; however, providers thought that database analyses are useful to supplement other data and drive future research. Likewise, providers generally felt that although guidelines provide a useful framework, they often have difficulty applying guidelines to individual patients. An analysis of provider characteristics revealed that younger physicians in practice for fewer years appeared more likely to report using guidelines, and physicians who were aged 50 years or more and not purely academic surgeons appeared to find database analyses less impactful.ConclusionsHealth services research, including database analyses, comprise much of the surgical literature; however, this study suggests that perceptions of database analyses and guidelines are mixed and questions whether thoracic surgeons routinely use either to inform their decisions. Researchers must address how to present compelling data to influence clinical practice.     

基于Apriori算法与网络药理学的藏医治疗肝胆疾病用药规律及机制分析＊

目的 挖掘藏医治疗肝胆疾病的用药规律，寻找核心药组，并预测核心药组的潜在靶点，以探讨核心药组治疗肝胆疾病的作用机制。方法 收集藏医药典籍中治疗肝胆疾病处方，采用SPSS软件进行Apriori算法关联规则分析得到藏医治疗肝胆疾病的核心药组。检索中药系统药理学分析平台（TCMSP）、Therapeutic Target Database （TTD）、Genecards、Metascape等数据库进行基因本体（GO）和KEGG富集分析。结果 共纳入607首方剂，数据挖掘得到藏医治疗肝胆疾病的核心药组为蒂达-洪连-波棱瓜子。收集到核心药组56个活性成分，作用于47个关键靶点，预测出1194条生物过程、49个细胞组成、54个分子功能以及226条信号通路。结论 藏医在治疗肝胆疾病中主要以“清赤巴热”为核心，所使用方剂中的药物多以苦味为主；核心药组治疗肝胆疾病可能是通过缓解体内氧化应激、降低炎症表达以及调节胆汁酸肝肠循环等作用机制。     

基于数据挖掘和网络药理学的血脂异常用药规律和作用机制研究＊

目的 从文献研究的角度出发，运用数据挖掘和网络药理学研究方法，探讨中医药在血脂异常治疗中的组成规律和作用机制研究，为该病的防治提供参考。方法 以1979-2019年“中国知网（CNKI）”、“万方数据”、“维普中文期刊”等数据库中检索到的中药复方治疗血脂异常文献为数据来源，采用中医传承辅助平台对其进行频次分析、关联规则分析和熵聚类方法分析，研究防治血脂异常方药组成规律，并在此基础上采用网络药理学方法，通过KEGG通路和基因本体富集分析，研究高频核心药物的生物信号通路，阐明其作用机制。结果 共计786篇文献符合检索条件，包含314味中药，发现48味高频中药，按照药物使用频次从高到低排序为：活血化瘀药、补虚药（健脾补肾为主）、利水渗湿药、消食化积药；药物性味以温、苦为主，归肝经和脾经最多；进一步关联分析得到高频药对（药组）17个；经过熵聚类分析发现潜在药物组合22个和新方组合11个。应用网络药理学研究方法，对核心药组“山楂、泽泻和决明子”的作用机制进行探索，发现其主要通过作用于包括雌激素受体1（ESR1）、大麻素受体1型（CNR1）、糖皮质激素受体基因（NR3C1）、环氧合酶2（PTGS2/COX2）等潜在靶点，干预三羧酸（TCA）循环、脂质代谢、脂肪酸降解等调节血脂相关的关键信号通路而发挥调节血脂作用。结论 中药治疗血脂异常以健脾补肾治其本，活血化瘀、消痰化积治其标的方法为主，核心药组的作用机制可能是通过干预脂质代谢和基础代谢相关通路发挥治疗作用。     

基于网络药理学中药复方“三药三方”治疗新冠肺炎的分期治疗分析＊

目的 本研究探究中药复方“三药三方”在新冠肺炎治疗发挥药理作用的多成分、多靶点和多通路的分子机理以及复方药味归经的中医联系，探究“三药三方”药理作用的异同。方法 通过ETCM数据库获取“三药三方”的成分、靶点、药味归经，用STRING数据库进行蛋白互作网络构建，用DAVID和Metascape数据库进行靶标功能富集分析，利用Cytoscape软件构建和分析可视化网络图。结果 “三药三方”多重点作用于脾经和肺经，初期和中期复方重点作用于肺经和胃经，重症期复方重点作用于肝经和心经，通用方的温性药比例最大，初期和中期复方寒性药比例最大，“三药三方”药味均以苦味、辛味、甘味为主。共同化合物中Alexandrin（胡萝卜甙）与Nsp（N7-MTase）（非结构蛋白C端鸟嘌呤-N7甲基转移酶），Oleanolic Acid（齐墩果酸）与E protein（ion channel）（包膜小膜蛋白）有良好结合力。复方调控共同之处：包含共同子模块γ-氨基丁酸受体亚基相互作用以及细胞色素、ATP依赖转位酶和核受体的相互作用，参与调控16条生物通路涉及①神经保护作用；②免疫调节以及抗炎症风暴调节；③内分泌调节以及性激素调控；④能量代谢调控；⑤药物代谢；⑥其他通路。不同之处：“三药三方”也存在各自特异调控的通路，金花清感颗粒和莲花清瘟胶囊参与ACE2相关通路Renin-angiotensin system（肾素-血管紧张素系统）的调节，同时6种复方有各自的子模块相互作用蛋白。结论 “三药三方”在治疗新冠病毒体现辨证论治、治病求因、正气存内、已病防变的中医治疗原则，并且通过网络药理学初步揭示“三药三方”功能调控以及异同之处，阐述“三药三方”通过多成分-多靶点-多通路的综合调控之间的异同关系。     

基于网络药理学和实验验证探讨路氏润燥汤治疗干燥综合征的分子机制＊

目的 通过网络药理学探索路氏润燥汤治疗干燥综合征的可能作用机制，并通过动物实验进行验证。方法 通过TCMSP数据库检索收集路氏润燥汤方中各药物生物信息，通过Genecard数据库检索收集干燥综合征的靶标蛋白，将药物和疾病的靶点信息进行交集，获得交集信息。将信息导入STRING平台获得PPI网络图，将筛选的得到的药物成分与靶点信息通过Cytospace软件构建“成分-靶点”网络图，利用DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析。通过动物实验对网络药理学预测出的通路信息进行验证。结果 路氏润燥汤主要通过影响肿瘤坏死因子、细胞因子，肿瘤坏死因子信号通路、IL-17信号通路等信号通路来治疗干燥综合征。结论 路氏润燥汤是通过多靶点、多通路来治疗干燥综合征，网络药理学可以对路氏润燥汤进行较为全面的预测，有助于临床实验研究。     

基于网络药理学和分子对接探讨补肾活血方治疗尿酸性肾病的作用机制＊

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨补肾活血方治疗尿酸性肾病（uric acid nephropathy， UAN）的分子作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库TCMSP筛选出补肾活血方的有效活性成分。通过PubChem、DrugBank、SymMap和SwissTargetPrediction数据库筛选出中药各成分作用靶点。借助GeneCards、DisGenet、malaCards和OMIN数据库获取尿酸性肾病的靶点基因。David绘图工具筛选出中药与疾病的交集靶点，利用Cytoscape3.9.0软件构建“中药-活性成分-疾病-靶点”网络关系图，并通过CytoNCA插件构建蛋白质相互作用网络（PPI），筛选得到核心靶点蛋白。采用AutoDock Vina 1.1.2软件将补肾活血方关键有效成分和核心靶点进行分子对接。最后运用乙胺丁醇和腺嘌呤诱导的尿酸性肾病模型对网络药理学预测的结果进行基础实验验证。结果 本研究共筛选得到补肾活血方治疗UAN的作用靶点234个，其中核心靶点19个，对应5种中药的113种有效成分。GO富集分析共得到925条基因功能信息，KEGG富集分析发现112条信号通路，涉及Toll样受体、NF-κB、PI3K-Akt、p53、TNF等信号通路治疗尿酸性肾病。分子对接结果显示，双脱甲氧基姜黄素、异黄酮等关键活性成分与ALB、MMP9、TLR4等关键核心靶点有较好的结合活性。动物实验结果显示，与模型组相比，补肾活血方组、非布司他组大鼠肾组织TLR4和NF-κB蛋白表达量和血清MMP-9水平明显降低（P<0.05）；血清ALB水平明升高（P<0.05）。结论 本研究提示，补肾活血方中关键活性成分可能通过抑制TLR4/NF-κB信号通路降低TLR4、NF-κB和MMP-9水平，减轻炎症反应，进而减少ALB漏出，发挥保护肾脏治疗尿酸性肾病的作用。